淄博教科产融合基地设置5个内设机构，分别为党政办公室、实践教学中心、财务资产中心、合作发展中心、后勤保障中心，级别为正科级，分别设主任1名，在基地管委会领导下开展工作。

1.党政办公室

负责研究制定基地工作规划、管理规章制度和组织实施工作；负责基地的综合协调和管理服务工作；负责基地的组织人事、宣传统战、工会等党政管理事务工作；负责基地实习实训学生的日常管理服务工作；完成管委会交办的其他工作。

2.实践教学中心

     负责基地的实践教学规划、协调和组织实施工作；负责基地的实践教学管理、专业与课程建设工作；负责实践教学平台建设及实践教学项目申报工作；负责基地的实验室日常管理工作；负责开展实验室技术安全教育培训，定期开展安全检查；负责基地化学品的申购、监督以及危险废弃物处置工作；完成管委会交办的其他工作。

3.合作发展中心

     负责基地的教科产融合规划制定和组织实施工作；负责拓展基地工作业务平台，构建校地、校企的合作交流培训体制机制；负责基地合作交流培训的组织实施、跟踪评估工作；负责基地的科技成果转移转化工作；完成管委会交办的其他工作。

4.后勤保障中心

负责基地的校园治安、消防安全、饮食服务、公寓管理、卫生保健、物业维修、防汛救灾、绿化养护等工作；负责基地的智慧化、信息化建设，保障基地的运转维护；负责管理、监督基地的服务外包工作；完成管委会交办的其他工作。

5.财务资产中心

负责基地的资金往来及管理、安全与增值工作，提报基地的年度预算、决算方案，组织开展会计核算、监督与财务管理工作；负责基地的国有资产管理工作；完成管委会交办的其他工作。